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Directions of work or proceedings

Atelier Grands Graphes et Bioinformatique

Abstract : Le groupe de travail d'EGC Grands Graphes et Bioinformatique se réunit pour la deuxième fois dans le cadre des ateliers de la conférence EGC. L'objectif de cet atelier est de réunir des chercheurs venant de plusieurs disciplines et s'intéressant au lien entre fouille de grands graphes et bioinformatique. De nombreux problèmes de biologie cellulaire reposent en eet sur des réseaux (similarité de séquences, interactions entre protéines, régulation entre gènes...) et les avancées technologiques actuelles rendent ces objets de plus en plus grands. L'étude de tels réseaux nécessite une étroite collaboration entre informaticiens, bioinformaticiens, mathématiciens et biologistes. Les contributions de l'atelier 2016 illustrent en particulier deux grandes questions qui se posent actuellement à la communauté de bioinformatique au vu de l'aux de données de type omics. La première est l'inférence du réseau d'intérêt, qu'il soit de type transcriptomique ou métabolique. Trois des contributions utilisent une telle étape avant de pousser leurs analyses et on peut voir qu'il n'y a pas consensus sur la manière d'aborder le problème. La seconde question au coeur de cet atelier est la manière d'extraire de la connaissance de ces réseaux, que ce soit en comparant diérents réseaux entre eux ou en étant simplement capable de les visualiser de façon plus pertinente. Nous tenons à remercier les auteurs pour la qualité de leurs contributions, ainsi que les comités de programme et d'organisation d'EGC qui ont permis à cet atelier de voir le jour.
Document type :
Directions of work or proceedings
Complete list of metadata

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03122986
Contributor : Lydia Boudjeloud-Assala Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, January 27, 2021 - 1:56:01 PM
Last modification on : Thursday, October 21, 2021 - 9:46:02 AM
Long-term archiving on: : Wednesday, April 28, 2021 - 6:49:13 PM

File

actes-GGB2016.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : hal-03122986, version 1

Citation

Etienne Birmelé, Mohamed Elati, Blaise Hanczar, Lydia Boudjeloud-Assala. Atelier Grands Graphes et Bioinformatique. 16e Journées des Connaissances (EGC 2016), Jan 2016, Reims, France. pp.40, 2016. ⟨hal-03122986⟩

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